Si nous avons appris une chose après la pandémie, c’est qu’il y a tellement plus à apprendre sur les effets de la COVID-19 sur la population. Une étude publiée dans Génomique microbienne nous a permis de mieux comprendre comment le virus affecte notre microbiome pulmonaire au fil du temps.
Un microbiome est une communauté de micro-organismes vivant ensemble dans un habitat particulier. Des études ont montré qu’il existe un équilibre délicat entre les bactéries qui jouent un rôle vital dans les systèmes vivants. Par exemple, l’intestin humain, les sols et les océans ont des communautés de microbiomes uniques. Le poumon était initialement considéré comme stérile, mais les scientifiques ont récemment découvert que, tout comme l’intestin, le poumon est colonisé par une variété de bactéries différentes qui peuvent avoir des effets positifs et négatifs sur la santé pulmonaire.
Des études antérieures sur le microbiome pulmonaire ont identifié comment d’autres infections virales respiratoires (telles que la grippe et le VRS) perturbent l’écosystème délicat des bactéries pulmonaires, mais on sait peu de choses sur la façon dont les infections par le SRAS-CoV-2 affectent notre microbiome des voies respiratoires supérieures (URT) sur temps.
L’URT a un microbiome distinct composé de toutes les parties du système respiratoire au-dessus de la trachée, y compris la cavité nasale. Le microbiome URT est une communauté dynamique, qui peut varier d’une personne à l’autre en fonction d’un certain nombre de facteurs, tels que la qualité de l’air, l’emplacement ou le tabagisme et les maladies pulmonaires.
En comparant les microbiomes URT d’un groupe d’individus sains à un groupe atteint de COVID-19 à l’aide du séquençage du gène de l’ARN ribosomal, les chercheurs ont pu observer les effets d’une infection COVID-19 sur la diversité bactérienne URT. Contrairement aux études précédentes, l’équipe a conçu une étude longitudinale qui a observé des changements au fil du temps, en prélevant des échantillons du groupe infecté par COVID-19 pendant 21 jours.
Bien que les résultats de l’étude soient prometteurs, d’autres recherches doivent avoir lieu pour explorer davantage cette relation. Cette recherche a été entreprise au plus fort de la pandémie, de sorte que les chercheurs étaient limités. L’étude a été menée sur un petit groupe de participants par ailleurs en bonne santé.
Les chercheurs espèrent que ce travail pourra être réalisé à l’avenir sur un groupe plus large de participants plus diversifiés. Comme il s’agit d’une étude observationnelle, il est également difficile de savoir si d’autres facteurs peuvent avoir affecté le microbiome URT et les mécanismes par lesquels cela a pu se produire.
« Ce que cette étude suggère, c’est que l’infection virale modifie votre microbiome respiratoire. Selon la façon dont le microbiome est modifié, cela peut potentiellement être prédictif du résultat. » A déclaré le Dr Suman Ranjan Das, auteur principal de l’étude. « La santé du microbiote URT est un facteur de risque modifiable, et si nous pouvons le modifier d’une manière ou d’une autre, nous pouvons potentiellement réduire l’impact du virus sur le corps. »
Le Dr Das espère que cette étude et une meilleure compréhension des perturbations microbiennes de l’URT induites par le SRAS-CoV-2 pourront aider à concevoir des interventions susceptibles de réduire la morbidité et la mortalité de cette maladie à l’avenir.
« Quand on est infecté, faut-il aussi prendre un cocktail de bactéries supplémentaire ? » Il poursuit : « Si nous pouvons modifier à la fois le microbiome pulmonaire et intestinal de la bonne manière, pouvons-nous obtenir un meilleur résultat ?
Les modifications du microbiome URT, telles que celles décrites dans cette étude, pourraient avoir des implications pour notre santé à long terme. Le microbiome joue un rôle important dans la santé et le bien-être. Des études ont identifié des liens entre le microbiome pulmonaire, le système immunitaire et le cerveau.
Dans un monde où plus de 670 millions de personnes ont été infectées par le COVID dans le monde, cela pourrait avoir des effets monumentaux à long terme sur la santé publique mondiale.
Plus d’information:
Christian Rosas-Salazar et al, Dynamique du microbiote des voies respiratoires supérieures suite au COVID-19 chez l’adulte, Génomique microbienne (2023). DOI : 10.1099/mgen.0.000957
Fourni par la Société de microbiologie