Peu après les attentats, le 3 avril, sept terroristes qui se cachaient dans un appartement de Leganés ont fait sauter le bâtiment et sont morts à l’intérieur. Tous étaient membres de la cellule jihadiste responsable du massacre. Aujourd’hui, seules trois des personnes condamnées sont toujours incarcérées en Espagne. Les attentats du 11 mars 2004 ont provoqué un changement significatif dans les efforts de lutte contre le terrorisme en Espagne et en Europe.