Wie WhiteLab Genomics KI einsetzt, um die Entwicklung von Gen- und Zelltherapien zu unterstützen • Tech

Wie WhiteLab Genomics KI einsetzt um die Entwicklung von Gen

Französisches Biotech-Unternehmen WhiteLab Genomik hat 10 Millionen US-Dollar an Finanzmitteln für eine KI-Plattform aufgebracht, die die Entdeckung und Entwicklung genomischer Therapien unterstützen soll.

Das 2019 in Paris gegründete WhiteLab Genomics, frischgebackener Absolvent von Y Combinator (YC), bietet Gen- und Zelltherapieunternehmen prädiktive Softwaresimulationen, um die Entwicklung von Gen- und Zelltherapien zu beschleunigen. Die Gentherapie ist für Uneingeweihte eine aufkommende Behandlung, bei der fehlende oder defekte Gene in Zellen ersetzt werden, um genetische Störungen zu korrigieren, während es bei der Zelltherapie darum geht, eine Zelle oder Zellgruppen zu verändern, um eine Wirkung im ganzen Körper auszulösen.

Tausende von Krankheiten, einschließlich Mukoviszidose, Parkinson und Alzheimer, gehen auf Fehler in der DNA eines Individuums zurück, und aufkommende Forschungen im Bereich Gen- und Zelltherapien können solche Erkrankungen schließlich an ihrer Quelle behandeln und die Notwendigkeit von Medikamenten oder Operationen ersetzen.

Die Entwicklung solcher Therapien ist jedoch in der Regel kostspielig, ohne dass garantiert wird, dass sie funktionieren. Aktuelle Methoden bei der Entwicklung neuer Gen- und Zelltherapien beinhalten laut David Del Bourgo, CEO und Mitbegründer von WhiteLab Genomics, typischerweise einen Trial-and-Error-Ansatz, bei dem Wissenschaftler eine wissenschaftliche Hypothese aufstellen und sie in einem Labor testen: Wenn sie erfolgreich ist, geht sie weiter die nächste Stufe, aber wenn sie nicht erfolgreich ist, fangen sie mit einer anderen Hypothese wieder von vorne an. Und hier kommt WhiteLab Genomics ins Spiel, mit einem Computeransatz, der maschinelles Lernen und Deep-Learning-Techniken miteinander verbindet, um mehrere wissenschaftliche Hypothesen gleichzeitig zu verarbeiten und verschiedene genetische Varianten zu betrachten, „um das beste molekulare Design für die Therapie vorherzusagen“, basierend auf den Zielen .

„Gen- und Zelltherapien leiden immer noch unter schlechter Wirksamkeit, immunologischen Nebenwirkungen und sehr hohen Entwicklungskosten“, erklärte Del Bourgo gegenüber Tech. „Wir stellen unseren Kunden umfassende Vorhersagemodelle zur Verfügung, die Genetik und Computerbiologie kombinieren, um die besten Kandidaten zu entwerfen und auszuwählen, die im Labor getestet werden.“

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Die Gründer von WhiteLab Genomics: CEO David Del Bourogo und Chief Science Officer Julien Cottineau Bildnachweis: WhiteLab Genomics

Zeig mir die Daten

Wie bei fast allen KI-Modellen verwendet WhiteLab Genomics unzählige Datensätze, um seine Algorithmen zu trainieren, die genomische, RNA-, onkologische und Protein-Repositories umfassen, zusätzlich zu „einer umfassenden Dokumentation“ wie öffentlichen wissenschaftlichen und klinischen Forschungsdaten.

„Wir arbeiten auch mit spezialisierten Institutionen zusammen, um die Modelle mit zusätzlichen nicht öffentlichen Daten anzureichern“, fügte Del Bourgo hinzu. „Wir trainieren und validieren unsere Algorithmen anhand gut charakterisierter Datensätze, die in unserer Knowledge Graph-Datenbank miteinander verbunden sind. Dazu gehörten öffentliche Datenbanken, proprietäre Daten und Datensätze unserer Partner. Es sagt biologische Merkmale aus neuen genetischen Sequenzen voraus, um neue therapeutische Vektoren aufzubauen und neue therapeutische Konstrukte zu erzeugen.“

In Bezug auf die Arten von Behandlungen, an deren Entwicklung WhiteLab Genomics mitwirkt, sagte Del Bourgo, dass das Unternehmen derzeit an Projekten arbeitet, darunter DNA-basierte Therapien für Stoffwechselerkrankungen wie z lysosomale Erkrankungensowie Zellstammtherapien für Blutkrankheiten wie z Sichelzellenanämie und Immungentherapien zur Behandlung von Krebs.

An anderer Stelle nutzen eine Reihe von Unternehmen KI zur Unterstützung der Arzneimittelforschung, wie z. B. BenevolentAI, das beträchtliche Investitionen getätigt hat aus der VC-Weltwährend es den Startup Battlefield-Gewinner von Tech gibt Cellin das kürzlich 80 Millionen US-Dollar für die Entwicklung von Zelltherapien mit KI gesammelt hat. WhiteLab Genomics ist ähnlich, funktioniert aber mit beiden Genen und Zelltherapie Unternehmen.

Es ist auch erwähnenswert, dass WhiteLab Genomics eine wachsende Liste französischer Startups repräsentiert, die erfolgreich die YC-Ränge infiltrieren. Von den 40 europäischen Unternehmen in der Winter-22-Kohorte von WhiteLab Genomics waren 5 französische Unternehmen, eine Zahl, die von 34 für die Sommer-22-Tranche auf 8 anstieg – die zweithöchste Zahl in ganz Europa.

Mit 10 Millionen Dollar auf der Bank von einem französischen Investor Omnes Hauptstadt und biopharmazeutisches Schwergewicht Debiopharm, WhiteLab Genomics ist jetzt gut finanziert, um seine Plattform auszubauen und seine Partnerschaften mit der Wissenschaft zu verdoppeln, die bisher bemerkenswerte Kooperationen mit umfasste das Französische Nationale Institut für Gesundheit und medizinische Forschung (Einfügen), Genethon-Laborsneben anderen Pharma- und Biotech-Unternehmen.

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