Meeresmikroben steuern den Stoff- und Energiefluss, der für das Leben in den Ozeanen unerlässlich ist. Unter ihnen macht die Bakteriengruppe SAR11 etwa ein Drittel aller im Oberflächenmeerwasser vorkommenden Bakterien aus.
Eine Studie von Forschern des Max-Planck-Instituts für Marine Mikrobiologie in Bremen zeigt nun, dass zeitweise fast 20 % der SAR11-Zellen mit Viren infiziert sind, was die Gesamtzahl der Zellen deutlich reduziert. Die Viren können diese einst blühenden Bakterien auch in Zombies verwandeln, ein erstmals beobachtetes und in den Ozeanen weit verbreitetes Phänomen. Die Arbeit ist veröffentlicht im Tagebuch Naturkommunikation.
Die Meeresgewässer rund um die deutsche Insel Helgoland bieten einen idealen Rahmen für die Untersuchung der Frühlingsalgenblüte, die seit 2009 ein Forschungsschwerpunkt am Max-Planck-Institut für Marine Mikrobiologie ist.
In einer früheren Studie beobachteten die Max-Planck-Wissenschaftler, dass während dieser Blüten eine Bakteriengruppe namens SAR11 besonders schnell wuchs. Trotz ihrer hohen Wachstumsraten verringerte sich die Häufigkeit von SAR11 jedoch innerhalb von fünf Tagen um etwa 90 %. Dies deutet darauf hin, dass die Zellen durch Fressfeinde und/oder Virusinfektionen schnell dezimiert wurden. Was genau hinter diesem Phänomen steckt, haben die Max-Planck-Forscher nun untersucht.
Auffinden der Phagen, die SAR11 infizieren
„Wir wollten herausfinden, ob die niedrigen SAR11-Zahlen durch Phagen verursacht werden, also Viren, die gezielt Bakterien infizieren“, erklärt Jan Brüwer, der die Studie im Rahmen seiner Doktorarbeit durchgeführt hat. „Die Beantwortung dieser scheinbar einfachen Frage war methodisch sehr anspruchsvoll.“
Wie funktioniert eine Phageninfektion? Phagen infizieren Bakterien, indem sie ihr genetisches Material in sie einschleusen. Dort repliziert es sich und nutzt die bakteriellen Ribosomen, um die benötigten Proteine zu produzieren. Bremer Forscher nutzten eine Technologie, die es ihnen ermöglichte, das Erbgut des Phagen im Inneren der Zelle zu „verfolgen“.
„Wir können die spezifischen Phagengene anfärben und sie dann unter dem Mikroskop betrachten. Da wir auch das genetische Material von SAR11 anfärben können, können wir gleichzeitig phageninfizierte SAR11-Zellen nachweisen“, erklärt Brüwer.
Auch wenn dies einfach erscheinen mag, erschwerten die geringe Helligkeit und die geringe Größe der Phagengene ihren Nachweis den Forschern. Dennoch wurden Tausende von Mikroskopbildern erfolgreich analysiert, was einige aufregende Neuigkeiten brachte.
„Wir haben gesehen, dass SAR11-Bakterien massiv von Phagen angegriffen werden“, sagt Brüwer. „Während Phasen schnellen Wachstums, wie sie etwa mit der Frühlingsalgenblüte einhergehen, waren fast 20 % der Zellen infiziert, was die geringe Zellzahl erklärt. Phagen sind also das fehlende Glied, das dieses Rätsel erklärt.“
Zombiezellen: Ein globales Phänomen
Zur Überraschung der Wissenschaftler enthüllten die Bilder noch mehr. „Wir haben herausgefunden, dass einige der phageninfizierten SAR11-Zellen keine Ribosomen mehr enthielten. Diese Zellen befinden sich wahrscheinlich in einem Übergangszustand zwischen Leben und Tod, daher haben wir sie ‚Zombie‘-Zellen genannt“, erklärt Brüwer.
Zombiezellen stellen ein neuartiges Phänomen dar, das nicht nur in reinen SAR11-Kulturen, sondern auch in vor Helgoland gesammelten Proben beobachtet wird. Darüber hinaus ergab die Analyse von Proben aus dem Atlantik, dem Südpolarmeer und dem Pazifischen Ozean das Vorhandensein von Zombiezellen, was darauf hindeutet, dass dieses Phänomen weltweit auftritt.
„In unserer Studie machen Zombiezellen bis zu 10 % aller Zellen im Meer aus. Das weltweite Vorkommen von Zombiezellen erweitert unser Verständnis des viralen Infektionszyklus“, betont Brüwer. „Wir vermuten, dass in Zombiezellen die in den Ribosomen enthaltenen Nukleinsäuren abgebaut und recycelt werden, um neue Phagen-DNA herzustellen.“
Brüwer und seine Kollegen vermuten, dass nicht nur SAR11-Bakterien, sondern auch andere Bakterien in Zombies verwandelt werden können. Daher wollen sie die Verbreitung von Zombiezellen und ihre Rolle im viralen Infektionszyklus weiter untersuchen.
„Diese neue Erkenntnis beweist, dass die SAR11-Population trotz ihrer schnellen Teilung massiv durch Phagen kontrolliert und reguliert wird“, sagt Brüwer.
„SAR11 ist sehr wichtig für globale biogeochemische Kreisläufe, einschließlich des Kohlenstoffkreislaufs, daher muss ihre Rolle im Ozean neu definiert werden. Unsere Arbeit beleuchtet die Rolle von Phagen im Meeresökosystem und die Bedeutung mikrobieller Interaktionen im Ozean.“
Mehr Informationen:
Jan D. Brüwer et al.: Weltweit auftretende Pelagiphagen-Infektionen erzeugen Ribosomen-deprivierte Zellen, Naturkommunikation (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-48172-w