Forscher des Oak Ridge National Laboratory, der University of Tennessee in Chattanooga und der Tuskegee University nutzten Mathematik, um vorherzusagen, welche Bereiche des SARS-CoV-2-Spike-Proteins am wahrscheinlichsten mutieren werden.
In einer Studie veröffentlicht in Polymereanalysierte das Team die Topologie von mehr als 13.000 Proteindatenbankstrukturen und stellte fest, dass Mutationen im Spike-Protein des Virus am wahrscheinlichsten in Bereichen mit hoher topologischer freier Energie auftraten, was ein Protein weniger stabil macht.
Die SARS-CoV-2-Omicron-Variante mutierte in einem Bereich, der mit den Berechnungen der Forscher übereinstimmt, was die Ergebnisse des Papiers bestätigt.
Diese Methodik ermöglicht es Wissenschaftlern, mithilfe von Mathematik vorherzusagen, wo Proteinmutationen auftreten können, und könnte auf jedes Protein angewendet werden, was möglicherweise die Tür für ein besseres Verständnis der Virusdynamik und effizientere Arzneimitteltherapien öffnet.
„Wir glauben, dass der Ansatz virusunabhängig ist“, sagte Bobby Sumpter vom ORNL. „Es basiert alles auf der Topologie von Proteinen.“
Quenisha Baldwin et al, The Local Topological Free Energy of the SARS-CoV-2 Spike Protein, Polymere (2022). DOI: 10.3390/polym14153014