Obwohl das Mikrobiom – die Ansammlung aller im Körper lebenden Mikroben – im Kot von Hunden umfassend untersucht wurde, waren diese Studien meist auf domestizierte Hunde beschränkt. In einer neuen Studie haben Forscher die fäkalen Mikrobiome in verschiedenen geografischen Populationen untersucht, um besser zu verstehen, wie sie auf der ganzen Welt aussehen.
„Viele der Studien untersuchen, wie sich unterschiedliche Ernährungsweisen auf die Mikrobiome von Hunden auswirken. Obwohl sie umfangreich sind, arbeiten sie mit Hunden in Veterinärzentren, die ein ganz anderes Leben führen als Hunde, die nicht als Haustiere leben“, sagte Karthik Yarlagadda, a ehemaliger Doktorand in der Malhi-Gruppe. „Es ist ähnlich, wie sich Studien über die Mikrobiome des Menschen auf Menschen konzentriert haben, die in Städten leben und verarbeitete Lebensmittel essen.“
Um eine Vielzahl von Mikrobiomen zu untersuchen, sammelten die Forscher Fäkalien von drei geografischen Orten: Haustiere aus Südafrika, streunende Hunde und Schutzhunde in Indien und Hunde aus einem ländlichen Dorf in Laos. Die Proben wurden auf FTA-Karten gesammelt, die Chemikalien enthalten, die die DNA konservieren, damit sie später sequenziert und analysiert werden kann.
„Die meisten unserer früheren Studien haben Tiere untersucht, die in eine Tierklinik kommen oder in einer Forschungseinrichtung untergebracht sind; sie sind geimpft und essen verarbeitete Lebensmittel“, sagte Kelly Swanson, Professorin für Tier- und Ernährungswissenschaften. „Aber das ist anders als bei Tieren wie denen in Laos, die draußen leben und einer Vielzahl von Umwelteinflüssen ausgesetzt sind. Durch die Durchführung dieser Studien können wir lernen, was für verschiedene Populationen auf der ganzen Welt als „normal“ gilt.“
An jedem Ort hatten die Hunde unterschiedliche Diäten. Die Tierheimhunde wurden mit Reis, Linsen, Joghurt und Hundefutter gefüttert; die streunenden Hunde haben wahrscheinlich menschliche Überreste gefressen; Die Dorfhunde verzehrten lokale landwirtschaftliche Produkte, darunter Mais, Mais, Bambus, Klebreis und Fisch aus nahe gelegenen Flüssen. und die Schoßhunde wurden wahrscheinlich mit kommerziellem Hundefutter gefüttert.
Obwohl sich die Mikrobiome der verschiedenen Populationen unterschieden, waren sie interessanterweise funktionell gleich. „Es war cool zu sehen, dass man verschiedene Mikrobiome haben kann, aber alle die gleiche Stoffwechselfunktion erfüllen. Zum Beispiel hatten Hunde, die in der südafrikanischen und indischen Population Milchprodukte konsumierten, unterschiedliche Lactobacillus-Arten, die wahrscheinlich am selben Stoffwechselweg beteiligt waren. “, sagte Yarlagadda.
Neben dem Vergleich der Mikrobiome von Hunden aus verschiedenen geografischen Regionen wollten die Forscher diese Proben mit alten Mikrobiomen vergleichen, die aus versteinertem Hundekot gewonnen wurden. Vermutlich haben Hunde, die im Freien leben und eine gemischte Ernährung haben, ähnliche Mikrobiome wie alte Hunde, was einen Einblick gibt, wie sich die Industrialisierung auf die fäkalen Mikroben auswirkt.
Die Forscher beobachteten tatsächlich, dass die Mikrobiome von alten Hunden den Populationen außerhalb der USA sehr ähnlich waren, möglicherweise aufgrund von sich überschneidenden Ernährungsweisen und mehr Umweltbelastungen. Weitere Arbeiten werden klären, ob die Vielfalt des menschlichen Mikrobioms in nicht-industriellen Umgebungen ebenfalls ähnlichen Trends folgen wird.
„Verwendung von Sequenzierungstechniken aus einer früheren Studie [in Scientific Reports]möchten wir mehr Daten über alte Mikrobiome in verschiedenen Hundearten finden“, sagte Ripan Malhi (GNDP/GSP/IGOH), Professor für Anthropologie. „Da wir wissen, woraus ihre Ernährung bestand, können wir mehr Vergleiche anstellen, um zu sehen, wie Ernährung beeinflusst das Mikrobiom.“
Die neue Studie „Geographisch vielfältige Canidenproben bietet neuartige Einblicke in vorindustrielle Mikrobiome“ wurde in veröffentlicht Verfahren der Royal Society B: Biologische Wissenschaften.
K. Yarlagadda et al., Geografisch vielfältige Caniden-Probenahme bietet neue Einblicke in vorindustrielle Mikrobiome, Verfahren der Royal Society B: Biologische Wissenschaften (2022). DOI: 10.1098/rspb.2022.0052
Kelsey E. Witt et al, Integrative Analyse von DNA, makroskopischen Überresten und stabilen Isotopen von Hundekoprolithen zur Rekonstruktion der Gemeinschaftsernährung, Wissenschaftliche Berichte (2021). DOI: 10.1038/s41598-021-82362-6