Neue Klasse antimikrobieller Wirkstoffe in Bodenbakterien entdeckt

Forscher haben giftige Proteinpartikel in Form von Regenschirmen entdeckt, die Bodenbakterien namens Streptomyces absondern, um Konkurrenten, insbesondere andere ihrer eigenen Art, zu unterdrücken.

Die Entdeckung der Regenschirmtoxinpartikel und die damit verbundenen Informationen über ihre Struktur, Zusammensetzung und Wirkungsweise waren veröffentlicht In Natur.

Die Schirmtoxinproteine ​​sind das jüngste Beispiel für die vielfältigen, kämpferischen Angriffe dieser Bakterien auf ihre mikroskopisch kleinen Rivalen. Die überfüllten, vielfältigen Bakteriengemeinschaften, in denen sie leben, sind ein Wirrwarr antimikrobieller Angriffe, Gegenangriffe und Abwehrmaßnahmen.

Ironischerweise leiten sich viele klinisch eingesetzte Antibiotika direkt von Molekülen ab oder sind von ihnen inspiriert, die Bakterien in ihrem natürlichen Lebensraum gegeneinander einsetzen. Die chemischen Waffen der Streptomyces gegen ihre Konkurrenten sind eine der ergiebigsten Quellen für solche Moleküle. Darunter ist das gängige Breitbandmedikament Streptomycin.

Das Besondere an diesen neu entdeckten antibakteriellen Toxinen ist, dass es sich bei Regenschirmtoxinen im Gegensatz zu den niedermolekularen Antibiotika der Streptomyces um große Komplexe handelt, die aus mehreren Proteinen bestehen. Sie sind außerdem weitaus spezifischer in Bezug auf die Bakterien, auf die sie abzielen.

Die Autoren des Artikels spekulieren, dass diese Eigenschaften der Regenschirmtoxine erklären, warum sie während der mehr als 100-jährigen Forschung zu den von Streptomyces produzierten Toxinen ihrer Entdeckung entgangen sind.

Gene, die für Umbrella-Toxine kodieren, wurden ursprünglich durch eine bioinformatische Suche nach neuen bakteriellen Toxinen entdeckt. In biochemischen und genetischen Experimenten unter der Leitung von Qinqin Zhao im mikrobiologischen Labor von Joseph Mougous an der University of Washington School of Medicine erfuhren die Wissenschaftler, dass diese Toxine mit anderen Proteinen in einem großen Komplex verbunden sind.

Die Kryo-Elektronenmikroskopie dieser Proteinkomplexe wurde von Young Park im Labor von David Veesler, Professor für Biochemie an der UW School of Medicine und Forscher am Howard Hughes Medical Institute, durchgeführt.

Diese Studien ergaben, dass die von Qinqin isolierten Toxinkomplexe ein auffälliges Aussehen annehmen, das zu ihrer Entdeckung in Seattle passt. Sie sehen aus wie Regenschirme.

„Die Form dieser Partikel ist ziemlich eigenartig, und es wird in zukünftigen Arbeiten interessant sein zu erfahren, wie ihre ungewöhnliche Morphologie ihnen hilft, Zielbakterien zu eliminieren“, bemerkte Mougous, Professor für Mikrobiologie an der UW School of Medicine und einem Howard Hughes Medical Institute Ermittler.

Anschließend versuchten die Wissenschaftler, die Angriffsziele dieser Toxine zu bestimmen, indem sie ihre Auswirkungen auf alle Organismen untersuchten, auf die sie möglicherweise abzielen könnten, von Pilzen bis hin zu 140 verschiedenen Bakterien, darunter einige aus Sorghumpflanzen im Labor des Studienautors Devin Coleman an der University of California. Berkeley und der Agrarforschungsdienst des US-Landwirtschaftsministeriums.

Unter diesen potenziellen Gegnern zielten die Toxine gezielt auf ihre eigenen Artgenossen: andere Streptomyces-Arten.

„Wir glauben, dass diese außerordentliche Spezifität möglicherweise auf die Proteine ​​zurückzuführen ist, aus denen die Speichen des Regenschirms bestehen und die sich zwischen den Partikeln unterscheiden. Dazu gehören Proteine, die sich möglicherweise an bestimmte Zucker binden, die auf der Oberfläche von Konkurrenzbakterien zu finden sind“, kommentierte Studienautor S. Brook Peterson, ein leitender Wissenschaftler im Mougous-Labor.

Durch die Analyse Tausender öffentlich verfügbarer Bakteriengenome fanden die Studienautoren Dapeng Zhang von der St. Louis University und sein Doktorand Youngjun Tan heraus, dass viele andere Bakterienarten ebenfalls über die Gene zur Herstellung von Regenschirmpartikeltoxinen verfügen. Interessanterweise bilden diese Arten alle verzweigte Filamente, eine für Bakterien ungewöhnliche Wachstumsart.

Zusätzlich zu den vielen noch zu beantwortenden Fragen zur grundlegenden Biologie der Umbrella-Toxin-Partikel sind Mougous und seine Kollegen von ihren möglichen klinischen Anwendungen fasziniert.

Sie vermuten, dass die Bakterien, die Tuberkulose und Diphtherie verursachen, möglicherweise empfindlich auf Regenschirmtoxine reagieren. Sie stellen fest, dass dieselben Bakterien gegen herkömmliche Antibiotika resistent geworden sind. Die Wissenschaftler schlugen vor, dass es sich lohnen könnte, die Partikel des Regenschirmtoxins zu untersuchen, da sie das Potenzial haben, diese schwerwiegenden krankheitserregenden Bakterien zu bekämpfen.

Mehr Informationen:
Joseph Mougous et al., Streptomyces-Schirmtoxinpartikel blockieren das Hyphenwachstum konkurrierender Arten. Natur (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-07298-z. www.nature.com/articles/s41586-024-07298-z

Zur Verfügung gestellt von der University of Washington School of Medicine

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