Eine in der Zeitschrift veröffentlichte Studie Gartenbauforschung versuchten, Loci zu identifizieren und die polygene Architektur des Apfelsäuregehalts in Tomatenfrüchten zu entschlüsseln. Die Autoren führten eine GWAS unter Verwendung von sechs Meilensteinmodellen mit Wiederholungen in zwei Umgebungen durch. Eine Reihe assoziierter SNP-Variationen wurde anhand von GWAS identifiziert, und 15 mit hoher Zuverlässigkeit annotierte Gene wurden basierend auf den Leit-SNPs und der Äpfelsäureakkumulation erhalten.
Die optimale allelische Kombination der 15 Loci wurde für eine schmackhaftere Tomate präsentiert. Die genetischen Parameter der Populationsdifferenzierung wurden verwendet, um potenzielle selektive Sweep-Signale auf Äpfelsäure während der Domestikation und Verbesserung zu identifizieren.
Die Autoren identifizierten natürliche Variationen, die Apfelsäure in Tomaten zugrunde liegen, mit Multimodell-GWAS. Diese Studie wird neue genetische Erkenntnisse darüber liefern, wie sich der Äpfelsäuregehalt von Tomaten während der Züchtung entwickelt hat, sowie optionale QTL-Kombinationen für einen höheren Apfelsäuregehalt in Tomaten.
Mehr Informationen:
Wenxian Gai et al., Multiple-model GWAS identifiziert optimale allelische Kombinationen von quantitativen Merkmalsloci für Äpfelsäure in Tomaten, Gartenbauforschung (2023). DOI: 10.1093/hr/uhad021