Das US-Landwirtschaftsministerium (USDA-ARS) hat bekannt gegeben, dass Forscher die Anzahl der Virusstämme der Afrikanischen Schweinepest (ASF) von 25 auf nur sechs einzigartige Genotypen umklassifiziert haben. Diese wissenschaftliche Innovation könnte dazu beitragen, die Klassifizierung von ASP-Virus (ASFV)-Isolaten durch ASP-Forscher auf der ganzen Welt neu zu definieren, und es Wissenschaftlern möglicherweise leichter machen, Impfstoffe zu entwickeln, die den verschiedenen Stämmen entsprechen, die in ASP-Endemiegebieten auf der ganzen Welt zirkulieren.
Die Arbeit ist veröffentlicht im Tagebuch Viren.
„Bisher wurden weltweit 25 verschiedene Virusgenotypen identifiziert“, sagte der leitende ARS-Wissenschaftler Douglas Gladue. „Unser Forschungsteam hat kürzlich die gesamte öffentlich verfügbare Virus-DNA-Sequenz neu bewertet und festgestellt, dass die Mehrzahl der ursprünglich als neu identifizierten Genotypen (genetische Zusammensetzung) weder korrekt identifiziert noch mit bereits vorhandenen ASFV-Virus-Genotypen verglichen wurden. Basierend auf dieser Analyse gibt es solche.“ Tatsächlich gibt es weniger einzigartige Genotypen, als die ASFV-Forschungsgemeinschaft glaubte, und das bedeutet, dass die Vielfalt der von ASPV betroffenen Gemeinschaften auf der ganzen Welt geringer ist. Diese Informationen sind wichtig, da sie möglicherweise die Anzahl der Impfstoffe reduzieren, die bisher als notwendig für den Schutz vor allen ASPV-Genotypen angesehen wurden .“
Eine genaue Klassifizierung von Viren ist für epidemiologische Untersuchungen und die Entwicklung kostengünstiger Gegenmaßnahmen, einschließlich der Entwicklung von Impfstoffen für einzigartige ASPV-Stämme, von größter Bedeutung.
Im Rahmen dieser groß angelegten Anstrengung analysierten ARS-Forscher über 12.000 historische und aktuelle Virusisolate, die in ASFV-Laboren weltweit hergestellt wurden, erneut. Möglich wurde dies durch die Rechenleistung von SciNet, dem Supercomputer-Cluster von ARS zur Lösung landwirtschaftlicher Big-Data-Probleme.
Obwohl das ASFV-Virus der weltweiten Schweineindustrie erhebliche wirtschaftliche Verluste verursacht, kam es in den Vereinigten Staaten nicht zu Ausbrüchen. Das hochansteckende ASP-Virus breitete sich 2007 von Afrika in die Republik Georgien aus und hat sich seitdem über Europa, die Dominikanische Republik und Asien ausgebreitet, bevor es Anfang 2023 Südafrika erreichte. Das Virus kann nicht von Schweinen auf Menschen übertragen werden.
Diese Forschung umfasst Forschungs- und Entwicklungsbeiträge der National Bio and Agro-Defense Facility, der Canadian Food and Inspection Agency und der Makerere University in Uganda.
Mehr Informationen:
Edward Spinard et al, Eine Neubewertung der Genotypen der Afrikanischen Schweinepest basierend auf p72-Sequenzen enthüllt die Existenz von nur sechs unterschiedlichen p72-Gruppen, Viren (2023). DOI: 10.3390/v15112246