Auf der Oberfläche von Pflanzenwurzeln leben Bakterien und Pilze zusammen, was symbiotische Interaktionen mit der Pflanze fördern kann. Besonders feine Pflanzenwurzeln können verschiedene Nischen für ihre mikrobielle Vermehrung beherbergen, doch traditionell wurden in Mikrobiomstudien Feinwurzelsysteme nicht getrennt von der Rhizosphäre untersucht.
Erkenntnisse, jetzt veröffentlicht In Pflanze, Zelle und Umweltzeigen, dass die Mikrobiome in der Wurzeloberflächenzone und der Rhizosphäre bei vier verschiedenen Baumarten unterschiedlich sind. Die Ergebnisse zeigten auch Unterschiede zwischen den bakteriellen Rhizoplane- und Rhizosphärenkompartimenten für absorbierende Feinwurzeln, nicht jedoch für transportive Feinwurzeln.
Die Entschlüsselung der Wirt-Mikroben-Beziehungen erfordert ein umfassendes Verständnis der Physiologie und Morphologie des Wirts – in diesem Fall der Pflanzenwurzeln. Die Klassifizierung von Feinwurzeln ist wichtig für die Beurteilung verschiedener ökologischer Prozesse, einschließlich feinskaliger biogeochemischer Kreisläufe und Wurzel-Mikroben-Beziehungen.
Die Ergebnisse dieser Studie zeigen, dass verschiedene Root-Kompartimente je nach Root-Funktionstyp und verfügbaren Ressourcen unterschiedlich strukturiert sind. Darüber hinaus liefern die Ergebnisse Hinweise darauf, dass die mikrobielle Zusammensetzung je nach Wurzelfunktionstyp räumlich strukturiert ist und dass für jedes Wurzelkompartiment selektive Drücke für verschiedene Wurzelfunktionstypen bestehen.
Diese Daten unterstreichen die Notwendigkeit, die Wurzelphysiologie bei der Untersuchung des Wurzel-Mikroben-Feedbacks genau zu untersuchen, da in einzelnen oder homogenisierten Wurzelkompartimenten mehr Informationen vorhanden sind als bisher angenommen.
Mikrobiomcluster in Pflanzenwurzeln spielen eine entscheidende, interaktive Rolle mit der Pflanze oder dem Wirt. Bei Mikrobiomstudien konzentrieren sich Forscher jedoch selten auf feine Wurzeln – 2 Millimeter oder weniger – und ihre unterschiedlichen funktionellen Rollen.
Anhand eines 26 Jahre alten Gartenwaldes sammelte ein multiinstitutionelles Forscherteam Feinwurzelproben von vier gemäßigten Baumarten (drei Laub- und eine Nadelbaumart), die sich in ihrer Morphologie unterschieden.
Mithilfe von Gensequenzierung und metabolomischer Analyse am Environmental Molecular Sciences Laboratory beobachteten Forscher, dass Feinwurzeln Funktionen unterteilen und dass Bakterien und Pilze innerhalb dieser Kompartimente unterschiedlich funktionieren. Dies ist wahrscheinlich darauf zurückzuführen, ob und wie in jedem Kompartiment Nährstoffressourcen verfügbar sind.
Darüber hinaus beobachteten die Forscher Unterschiede in den Daten von Rhizoplanes und Rhizosphären. Die Bakterien in den Rhizoplanes – der Wurzeloberfläche und den unmittelbar umgebenden Bodenpartikeln – sowie das Wurzelmetabolom und potenzielle mikrobielle Funktionen unterschieden sich zwischen absorbierenden und transportierenden Feinwurzeln. Aber die Bakterien in der Rhizosphäre – dem biogeochemischen Boden in der Nähe der Wurzeln – veränderten sich nicht.
Diese Ergebnisse zeigen die Bedeutung der Wurzelfunktion bei der Untersuchung der Wurzel-Mikroben-Beziehungen und betonen den unterschiedlichen wirtsselektiven Druck, der auf verschiedene Kompartimente des Wurzelmikrobioms ausgeübt wird.
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William L. King et al. Funktionell diskrete Feinwurzeln unterscheiden sich in der mikrobiellen Anordnung, dem mikrobiellen Funktionspotenzial und den produzierten Metaboliten. Pflanze, Zelle und Umwelt (2023). DOI: 10.1111/pce.14705