Eine Suche nach der Digitalisierung von 1 Million Pflanzenproben

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Das Australian National Herbarium in Canberra bildet fast eine Million Pflanzenproben mit einem automatisierten System ab, das von der niederländischen Firma Picturae entwickelt wurde.

CSIRO-Gruppenleiter für Digitalisierung und Informatik, Pete Thrall, der digitale Bestände bei den National Research Collections Australia beaufsichtigt, die von CSIRO, Australiens nationaler Wissenschaftsagentur, verwaltet werden, sagte, das Projekt würde dazu beitragen, die Wiederherstellung von Buschbränden und die Biosicherheit zu informieren.

„Die Digitalisierung des Herbariums ist ein großer Fortschritt für den Austausch von Exemplaren für die Forschung. Als Ergebnis werden wir in der Lage sein, schnell Informationen für Projekte wie die Wiederherstellung von Buschbränden und die Biosicherheit bereitzustellen“, sagte Herr Thrall.

„Die Erstellung einer digitalisierten Replik bietet auch Sicherheit für die unersetzlichen physischen Exemplare des Herbariums“, sagte er.

Frau Emma Toms, Imaging-Managerin von Parks Australia, die am Australian National Herbarium arbeitet und das Picturae-Projekt koordiniert, sagte, dass die Arbeiten in den nächsten 9 Monaten abgeschlossen würden.

„Um diese Proben im Haus zu digitalisieren, hätten wir mit einem Standardkamera-Rig etwa acht Jahre gebraucht“, sagte sie.

„Der erste Schritt ist eine Sichtprüfung jedes Exemplars, um sicherzustellen, dass es in gutem Zustand ist und einen Barcode hat, der mit seiner digitalen Aufzeichnung verknüpft werden kann.

„Drei Personen bedienen das Förderband von Picturae, das Proben unter einer Kamera bewegt, um ein hochauflösendes Foto aufzunehmen. Zwei Personen packen die Proben am Anfang des Förderbands aus und eine Person packt die Proben wieder ein und überprüft die Fotos auf Fehler“, sagt sie sagte.

Eine der neuen Technologien, die die Nutzung von Sammlungen verändert, ist künstliche Intelligenz (KI).

CSIRO Postdoc Dr. Abdo Khamis sagte, dass maschinelles Lernen und KI es Forschern ermöglichen, Merkmalsinformationen aus Bildern zu extrahieren.

„Wir können digitalisierte Herbarproben verwenden, um zu verstehen, wie Pflanzen auf den Klimawandel reagieren, indem wir zum Beispiel bestimmen, wie sich die Fortpflanzungsstruktur von Blumen mit der Zeit verändert“, sagte er.

Das Team wird die digitalen Bestände des Herbariums weiter ausbauen, da der Sammlung weitere Pflanzenproben aus Australien und der Region hinzugefügt werden.

„Wir werden ein internes Digitalisierungsprogramm haben, sobald dieser Prozess abgeschlossen ist, sodass neue Exemplare fotografiert werden, bevor sie in die Sammlung aufgenommen werden“, sagte Emma Toms.

Die vollständige digitale Sammlung des Australian National Herbarium wird über den Atlas of Living Australia auch für die breite Öffentlichkeit zugänglich gemacht.

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