Dass die Natur eine hervorragende Chemikerin ist, zeigt die Fülle an Molekülen, sogenannten Naturstoffen, die sie biosynthetisch herstellt. Auch für uns Menschen sind diese Naturprodukte von zentraler Bedeutung. Sie werden in unserem Alltag vielfältig eingesetzt, insbesondere als Wirkstoffe in Medizin und Landwirtschaft. Prominente Beispiele sind Antibiotika wie aus Schimmelpilzen isolierte Peniziline, das Krebsmedikament Taxol aus der pazifischen Eibe oder Pyrethrine aus Chrysanthemen, die zur Bekämpfung von Schädlingsbefall eingesetzt werden.
Das Wissen und Verständnis des biosynthetischen Aufbaus solcher Verbindungen in der Natur ist für die Entwicklung und Herstellung von Arzneimitteln auf der Basis solcher Verbindungen wesentlich. Forscherinnen und Forscher aus den Gruppen von Prof. Tobias Gulder (TU Dresden) und Prof. Tanja Gulder (Universität Leipzig) untersuchten in diesem Zusammenhang gemeinsam die Biosynthese von Cyanobacterin, das für Photosynthese-Organismen hochgiftig ist und in geringen Mengen von der Natur produziert wird Cyanobakterium Scytonema hofmanni. In ihrer Arbeit konnten die (Bio-)Chemiker nicht nur erstmals die Biosynthese des Naturstoffs aufklären, sondern auch eine neuartige enzymatische Umwandlung zur Knüpfung von Kohlenstoff-Kohlenstoff-Bindungen entdecken.
Diese Arbeit wurde durch die Kombination moderner Werkzeuge aus Bioinformatik, synthetischer Biologie, Enzymologie und (bio)chemischer Analytik ermöglicht. Im Mittelpunkt stand die Frage, wie der zentrale Teil des Cyanobacterin-Kohlenstoffskeletts hergestellt wird. Die mutmaßlichen Gene dafür wurden zunächst nach der Methode des „Direct Pathway Cloning“ (DiPaC) kloniert und anschließend im Modellorganismus E. coli als Zellfabrik aktiviert.
DiPaC ist eine neue Methode der synthetischen Biologie, die zuvor im Labor von Tobias Gulder, Professor für Technische Biochemie an der TU Dresden, entwickelt wurde. „Mit DiPaC können wir ganze Biosynthesewege von Naturstoffen sehr schnell und effizient in rekombinante Wirtssysteme übertragen“, erklärt Tobias Gulder.
Im nächsten Schritt analysierte das Forscherteam die wesentlichen Einzelschritte der Cyanobacterin-Biosynthese, indem es zusätzlich alle Schlüsselenzyme im Wirtsorganismus E.coli produzierte, isolierte und anschließend die Funktion jedes Enzyms untersuchte. Dabei stießen sie auf eine bisher unbekannte Enzymklasse namens Furanolid-Synthasen. Diese sind in der Lage, die Bildung von Kohlenstoff-Kohlenstoff-Bindungen nach einem ungewöhnlichen Mechanismus zu katalysieren. In weiteren Untersuchungen dieser Furanolid-Synthasen erwiesen sich diese Enzyme als effiziente In-vitro-Biokatalysatoren, was sie für biotechnologische Anwendungen äußerst attraktiv macht.
„Mit den Furanolid-Synthasen haben wir ein enzymatisches Werkzeug erhalten, mit dem wir zukünftig umweltfreundlichere Methoden zur Herstellung von bioaktiven Verbindungen entwickeln und damit wesentliche Beiträge zu einer nachhaltigeren Chemie leisten können“, erklärt Prof. Tanja Gulder vom Institut für Organische Chemie der Universität Leipzig.
Als nächstes wollen die beiden Forscherteams gezielt nach diesen neuartigen Biokatalysatoren auch in anderen Organismen suchen und so neue bioaktive Mitglieder dieser Naturstoffklasse finden sowie Methoden zur biotechnologischen Herstellung und Strukturdiversifizierung von Cyanobacterin entwickeln. „Unsere Arbeit ebnet den Weg für die umfassende Entwicklung einer spannenden Klasse von Naturstoffen für Anwendungen in Medizin und Landwirtschaft“, sind sich die beiden Wissenschaftler einig.
Die Studie wurde veröffentlicht in Naturchemische Biologie.
Paul M. D’Agostino et al., Biosynthese von Cyanobacterin, ein Paradigma für den Aufbau von Furanolid-Kernstrukturen, Naturchemische Biologie (2022). DOI: 10.1038/s41589-022-01013-7