Der Einsatz winziger Fallen zur Untersuchung von Proteininteraktionen kann neue Erkenntnisse über schwer behandelbare Krankheiten liefern

Proteine, die Klumpen bilden, kommen bei vielen schwer behandelbaren Krankheiten wie ALS, Alzheimer und Parkinson vor. Die Mechanismen hinter der Interaktion der Proteine ​​untereinander sind schwer zu untersuchen, doch jetzt haben Forscher der Technischen Universität Chalmers, Schweden, eine neue Methode entdeckt, um viele Proteine ​​in Fallen in Nanogröße einzufangen. Im Inneren der Fallen können die Proteine ​​auf eine Weise untersucht werden, die bisher nicht möglich war.

„Wir glauben, dass unsere Methode großes Potenzial hat, das Verständnis früher und gefährlicher Prozesse bei einer Reihe verschiedener Krankheiten zu verbessern und schließlich zu Erkenntnissen darüber zu führen, wie Medikamente ihnen entgegenwirken können“, sagt Andreas Dahlin, Professor an der Chalmers University, der das Forschungsprojekt leitete .

Die Forschung wurde kürzlich in dem wissenschaftlichen Artikel „Stabiles Einfangen mehrerer Proteine ​​unter physiologischen Bedingungen mithilfe nanoskaliger Kammern mit makromolekularen Toren“ vorgestellt veröffentlicht In Naturkommunikation.

Proteine, die in unserem Körper Klumpen bilden, verursachen eine Vielzahl von Krankheiten, darunter ALS, Alzheimer und Parkinson. Ein besseres Verständnis darüber, wie sich die Klumpen bilden, könnte zu wirksamen Methoden führen, sie frühzeitig aufzulösen oder sogar ihre Bildung ganz zu verhindern. Heutzutage gibt es verschiedene Techniken, um die späteren Stadien des Prozesses zu untersuchen, wenn die Klumpen groß geworden sind und lange Ketten gebildet haben. Bisher war es jedoch schwierig, die frühe Entwicklung zu verfolgen, wenn sie noch sehr klein sind. Diese neuen Fallen können nun helfen, dieses Problem zu lösen.

Die Forscher beschreiben ihre Arbeit als die kleinsten Tore der Welt, die sich per Knopfdruck öffnen und schließen lassen. Die Tore werden zu Fallen, die die Proteine ​​in Kammern im Nanomaßstab einschließen. Die Proteine ​​werden am Entweichen gehindert, wodurch sich die Beobachtungszeit auf dieser Ebene von einer Millisekunde auf mindestens eine Stunde verlängert. Die neue Methode ermöglicht es außerdem, mehrere hundert Proteine ​​in einem kleinen Volumen einzuschließen, ein wichtiges Merkmal für das weitere Verständnis.

„Die Klumpen, die wir sehen und besser verstehen wollen, bestehen aus Hunderten von Proteinen. Wenn wir sie also untersuchen wollen, müssen wir in der Lage sein, so große Mengen einzufangen. Die hohe Konzentration in dem kleinen Volumen bedeutet, dass die Proteine ​​auf natürliche Weise zusammenstoßen.“ einander, was ein großer Vorteil unserer neuen Methode ist“, sagt Dahlin.

Damit die Technik zur Untersuchung des Verlaufs spezifischer Krankheiten eingesetzt werden kann, ist eine Weiterentwicklung der Methode erforderlich. „Die Fallen müssen so angepasst werden, dass sie die Proteine ​​anlocken, die mit der jeweiligen Krankheit in Zusammenhang stehen, an der Sie interessiert sind. Wir arbeiten derzeit daran, zu planen, welche Proteine ​​am besten für die Untersuchung geeignet sind“, sagt Dahlin.

So funktionieren die neuen Fallen

Die von den Forschern entwickelten Tore bestehen aus sogenannten Polymerbürsten, die an der Mündung nanometergroßer Kammern positioniert sind. Die zu untersuchenden Proteine ​​liegen in einer flüssigen Lösung vor und werden nach einer speziellen chemischen Behandlung von den Wänden der Kammern angezogen. Wenn die Tore geschlossen sind, können sich die Proteine ​​von den Wänden lösen und beginnen, sich aufeinander zu zu bewegen.

In den Fallen können Sie einzelne Proteinklumpen untersuchen, was viel mehr Informationen liefert als die gleichzeitige Untersuchung vieler Klumpen. Beispielsweise können die Klumpen durch unterschiedliche Mechanismen gebildet werden und unterschiedliche Größen und unterschiedliche Strukturen aufweisen. Solche Unterschiede können nur beobachtet werden, wenn man sie einzeln analysiert.

In der Praxis können die Proteine ​​fast beliebig lange in den Fallen zurückgehalten werden. Derzeit ist die Zeit jedoch dadurch begrenzt, wie lange der chemische Marker, mit dem sie versehen werden müssen, um sichtbar zu werden, verbleibt. In der Studie gelang es den Forschern, die Sicht bis zu einer Stunde lang aufrechtzuerhalten.