Beschleunigung des Wissensaustauschs in der Genomik und Bioinformatik der afrikanischen Biodiversität

Seit seiner Gründung im Jahr 2021 hat das African BioGenome Project (AfricaBP) seinem ehrgeizigen Ziel, innerhalb der nächsten 10 Jahre 100.000 endemische afrikanische Arten zu sequenzieren, erhebliche Fortschritte gemacht. Kürzlich AfricaBP berichtete über die erfolgreiche Umsetzung des Open Institute im Tagebuch Naturbiotechnologie.

Der Rahmen des AfricaBP Open Institute wird öffentlich zugängliche Workshops in ganz Afrika einrichten, die in enger Zusammenarbeit mit lokalen afrikanischen Institutionen gestaltet werden. Das Hauptziel des Open Institute besteht darin, Lehrpläne für Biodiversitätsgenomik und Bioinformatik zu entwickeln und den Wissensaustausch an der Basis zu fördern, der sich an den Anforderungen afrikanischer Wissenschaftler orientiert.

Seit 2022 veranstaltet das Open Institute in Zusammenarbeit mit afrikanischen Institutionen und Organisationen sowie globalen Partnern wie der University of Port Harcourt (Nigeria), Inqaba Biotechnical Industries (Südafrika) und dem Vertebrate Genome Project (USA) gut besuchte Workshops. jeweils. Über 700 registrierte Teilnehmer aus 29 Ländern informierten sich über die Spitzentechnologien, die den Bereich Biodiversität und Genomik prägen. Die Veranstaltungen boten Einblicke in verschiedene Aspekte der Genomik und Bioinformatik, einschließlich des Verständnisses aktueller globaler Genomdatenbanken, Tools und Ressourcen.

„Die hohe Anzahl an Bewerbungen, die wir für jeden Workshop erhalten, zeigt, dass in Afrika Bedarf und Bedarf an Schulungen in Bioinformatik und Genomik besteht. Das Open Institute versucht, diesem Problem zu begegnen, indem es die Workshops und Schulungen nahezu kostenlos zugänglich macht.“ Teilnehmer“, sagte Prof. Anne WT Muigai, Vorsitzende des African BioGenome Project und Professorin an der National Defense University-Kenya, Kenia.

„Das African BioGenome Project Open Institute for Genomics and Bioinformatics, eine Plattform für Kapazitätsaufbau und Wissenstransfer, stattet Wissenschaftler, Studenten und lokale Institutionen in Afrika mit den erforderlichen Fähigkeiten und Kapazitäten aus, um nachhaltige Forschung und Entwicklung in den Bereichen Bioinformatik, Datenwissenschaft, Genomik voranzutreiben . Dies ist unser Beitrag zur Schließung der kritischen Lücken bei menschlichen, infrastrukturellen und technischen Fähigkeiten, die weiterhin die Möglichkeiten zur Nutzung von Innovationen in Wissenschaft und Technologie in Afrika einschränken“, sagte Prof. Appolinaire Djikeng, Senior Director, Livestock-Based Systems, CGIAR, Generaldirektor , International Livestock Research Institute (ILRI) und Mitbegründer von AfricaBP.

Das Open Institute of AfricaBP zielt darauf ab, einige der Hindernisse abzubauen, die die Weiterentwicklung des Wissensaustauschs über Biodiversitätsgenomik und Bioinformatik in ganz Afrika behindern, indem es sich auf fünf Hauptprioritätsbereiche konzentriert:

  • Lehrplanentwicklung
  • Technologieentwicklung und Infrastruktur
  • Förderung des Wissensaustauschs an der Basis und gleichberechtigter Partnerschaften
  • Maximierung des Dateneigentums und der Datensouveränität
  • Wissenschaftliches Unternehmen und Industrie
  • Mit Blick auf die Zukunft des Open Institute wird AfricaBP seine Reichweite erweitern, um die Vertretung von Teilnehmern aus dem gesamten Kontinent zu erhöhen, insbesondere in Gebieten, in denen derzeit nur eine minimale genomische Aktivität vorliegt. Die Teilnehmer der Veranstaltungen im Jahr 2022 zeigten sich zufrieden mit der Bereitstellung von Material und Inhalten und zeigten Interesse an der Teilnahme an zukünftigen und bevorstehenden Workshops. Derzeit sind bis Ende 2023 fünf weitere Workshops geplant, darunter zwei Online- und drei Hybrid-Workshops.

    „Eine der größten Bedeutung des AfricaBP Open Institute for Genomics and Bioinformatics ist seine Aktualität zu einem Zeitpunkt, an dem das Abkommen über die Afrikanische Kontinentale Freihandelszone (AfCFTA) bereits in Kraft ist. Durch eine solche Wissensaustauschplattform gibt es einen wirtschaftlichen Fall und.“ „Eine Rechtfertigung für Organisationen, afrikanische nationale Wissenschaftsbehörden sowie lokale und internationale Partner, diese Bemühungen zu unterstützen, die Afrika auf dem richtigen Weg für eine föderierte Genom- und Bioinformatik-Infrastruktur halten, die zur Bioökonomie Afrikas beitragen wird“, sagte Dr. ThankGod Echezona Ebenezer, Gründerin und Co -Vorsitzender des African BioGenome Project und Bioinformatiker an der University of Cambridge School of Clinical Medicine, Großbritannien.

    „Als SFA Foundation konzentrieren wir uns voll und ganz auf die Verbesserung der Quantität, Qualität und Produktivität der Wissenschaft in Afrika, was qualifizierte wissenschaftliche Arbeitskräfte durch die Entwicklung weltweit wettbewerbsfähiger wissenschaftlicher Führungskräfte in Afrika erfordert. Das Open Institute dient unserem Ziel, zukünftige Generationen auszubilden von Wissenschaftlern, die Daten generieren werden, um die Politik und die Entwicklungsagenda Afrikas zu informieren“, sagte Prof. Tom Kariuki, Chief Executive Officer der Science for Africa Foundation, Kenia

    Wenn der Rahmen und die Leitlinien des AfricaBP Open Institute in den nächsten 10 Jahren erfolgreich umgesetzt werden, wird das Open Institute schätzungsweise mindestens 200.000 afrikanische Wissenschaftler in Genomik und Bioinformatik ausbilden. Dies wird die infrastrukturelle und technische Kapazitätslücke schließen, die im Bereich Biodiversität und Genomik besteht, und eine kritische Masse von Forschern in ganz Afrika aufbauen, um die Mission und Vision des African BioGenome Project voranzutreiben.

    Das AfricaBP ist ein angeschlossener Projektpartner des Earth BioGenome Project und des Vertebrate Genomes Project.

    Mehr Informationen:
    Abdoallah Sharaf et al., Überbrückung der Lücke in der Genomik und Bioinformatik der afrikanischen Biodiversität, Naturbiotechnologie (2023). DOI: 10.1038/s41587-023-01933-2

    Bereitgestellt vom African BioGenome Project

    ph-tech