Proteine sind Hauptbausteine in allen lebenden Organismen. Sie werden oft als Arbeiter der Zelle bezeichnet, wo sie – gemeinsam oder einzeln – zahlreiche wesentliche Aufgaben erfüllen. Geht etwas schief, sind die Folgen oft schwerwiegend. Sowohl die Forschung als auch das Gesundheitswesen haben den Bedarf an effektiven Werkzeugen zur Analyse der Funktionen und Aktivitäten von Proteinen in einem neuen Artikel in einer wissenschaftlichen Zeitschrift zum Ausdruck gebracht Naturkommunikationstellt das Team von Professor Ola Söderberg MolBoolean vor, eine Technologie, von der erwartet wird, dass sie wichtige Türen in der Zell- und Krebsforschung öffnet.
„MolBoolean ist eine Methode, um die Spiegel eines Proteinpaars in einzelnen Zellen zu bestimmen und gleichzeitig den Prozentsatz dieser Proteine zu bestimmen, die aneinander binden. Wir haben ein Tool weiterentwickelt, das wir 2006 erstellt haben und das heute überall verwendet wird die Welt, und die Funktionen, die wir jetzt hinzufügen, generieren Informationen über die relativen Mengen verschiedener Proteine sowie die relativen Mengen von Proteinkomplexen und machen so den Aktivitätsstatus und die Kommunikation der Zellen sichtbarer“, sagt Ola Söderberg, Professor für Pharmazeutische Zelle Biologie an der Universität Uppsala. „Das ist vergleichbar mit der Bewertung eines Restaurants; 10 positive Bewertungen geben Aufschluss, aber es ist wichtig zu wissen, ob sie auf zehn oder 1.000 Meinungen beruhen“,
Die Ergebnisse der Gruppe wecken sowohl in der Wissenschaft als auch in der Industrie großes Interesse, und derzeit bereitet das in Stockholm ansässige Unternehmen Atlas Antibodies – das kürzlich das Patent für MolBoolean übernommen hat – die Methode für den Markt vor. Es wird erwartet, dass das Tool in der Forschung und langfristig auch im Gesundheitswesen von großem Wert sein wird, um die Diagnose und die Wahl der Behandlung von Krebs zu verbessern.
„Unsere Forschung zielt darauf ab, Werkzeuge zu entwickeln, um Prozesse innerhalb von Zellen zu visualisieren und beispielsweise das Wissen darüber zu erweitern, was in Krebszellen passiert. Das Gleichgewicht zwischen freien und interagierenden Proteinen zu kennen, ist wichtig, wenn man Zellsignale untersucht, und wir glauben, dass MolBoolean es sein wird in vielen Forschungslabors geschätzt“, sagt Doroteya Raykova, Forscherin am Department of Pharmaceutical Biosciences und Erstautorin des Artikels.
MolBoolean wird von Ola Söderbergs Gruppe an der Fakultät für Pharmazie der Universität Uppsala entwickelt. Die Arbeit wurde in Zusammenarbeit mit Forschern der Universitäten Porto und Uppsala, SciLifeLab und Atlas Antibodies durchgeführt.
Doroteya Raykova et al, Eine Methode zur Booleschen Analyse von Proteininteraktionen auf molekularer Ebene, Naturkommunikation (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-32395-w