Förderung von Mikrobiom-Datenstandards, um die Forschung voranzutreiben

Forscher haben vorausgesagt, dass auf unserem Planeten möglicherweise eine Billion Mikrobenarten beheimatet sind. Gemeinschaften dieser Mikroorganismen, sogenannte Mikrobiome, die in bestimmten Umgebungen existieren, sind unglaublich wichtig für die Gesundheit aller Menschen, vom einzelnen Menschen bis hin zu kompletten Ökosystemen. Um Mikrobiome zu untersuchen, müssen Wissenschaftler Daten auf standardisierte Weise sammeln, verarbeiten und teilen. Forscher der National Microbiome Data Collaborative (NMDC) versuchen, von der Gemeinschaft unterstützte Mikrobiom-Datenstandards zu entwickeln.

In einem kürzlich veröffentlichten Naturmikrobiologie In diesem Artikel untersuchen Forscher die Auswirkungen eines Community-Learning-Botschafterprogramms. Das Ambassador-Programm wurde 2021 vom NMDC ins Leben gerufen, um das Bewusstsein und die Übernahme von Mikrobiomdaten und Metadatenstandards in der Forschungsgemeinschaft zu fördern, die sich mit der Sammlung und Analyse von Mikrobiomdaten befasst. Während der einjährigen Laufzeit des Ambassador-Programms nahmen mehr als 800 Forscher an 23 von Ambassador veranstalteten Präsentationen teil.

Von 2021 bis 2022 schulten NMDC-Teammitglieder ihre Community-Learning-Kohorte über die Bedeutung von Metadatenstandards. Anschließend nutzten die Botschafter die Schulungsmaterialien, um ihre eigenen Veranstaltungen und Workshops durchzuführen. Diese Veranstaltungen trugen zur Verbreitung der NMDC-Mission bei und erweiterten das NMDC-Community-Netzwerk, indem sie ein vielfältigeres Publikum erreichten. Das Programm unterstützte die Personalentwicklung durch die Verbesserung der Präsentationsfähigkeiten der Botschafter. Es bot auch wichtige Networking-Möglichkeiten an einer Vielzahl von Veranstaltungsorten.

Forscher haben eine unglaubliche Menge an Daten über die Mikroben gesammelt, die in vielen Umgebungen vorkommen. Die Informationen, die im Zusammenhang mit diesen Daten gesammelt werden, werden Metadaten genannt. Metadaten könnten beispielsweise Informationen darüber enthalten, wo eine bestimmte Probe gefunden wurde. Sobald Forscher Daten und Metadaten gesammelt haben, möchten sie diese mit anderen teilen. Doch solange Daten nicht auf standardisierte Weise erfasst, verarbeitet und weitergegeben werden, haben andere Forscher Schwierigkeiten, sie wiederzuverwenden.

Das NMDC hat das Ambassador-Programm ins Leben gerufen, um Forscher über die Vorteile von Metadatenstandards aufzuklären. Von den 56 Bewerbern nahm das Programm zwölf Nachwuchsforscher von Universitäten, Regierungsbehörden und Forschungsorganisationen auf. Das NMDC-Team veranstaltete sechs Schulungssitzungen für die Botschafter. Diese Sitzungen umfassten Best Practices in den Bereichen Datenmanagement, Datenstandards und Community-Engagement. Anschließend veranstalteten die Botschafter persönliche und virtuelle Veranstaltungen mit ihren jeweiligen Mikrobiom-Forschungsgemeinschaften.

Erkenntnisse aus der Kohorte lieferten dem NMDC-Team Ideen zur Verbesserung zukünftiger Iterationen des Programms. Das NMDC-Team rekrutiert jährlich Nachwuchsforscher für das Ambassadors-Programm. Die Kohorte 2023 des NMDC-Botschafterprogramms verfügt über einen erweiterten Umfang, der sich auf mehrere Aspekte der Verwaltung von Mikrobiomdaten konzentriert, einschließlich Methoden zur Datenerfassung, -verarbeitung und -wiederverwendung. Ziel des Ambassador-Programms ist es, im Laufe der Zeit eine bessere Nutzung und Wiederverwendung von Mikrobiomdaten zu fördern.

Mehr Informationen:
Julia M. Kelliher et al., Kohortenbasiertes Lernen für Standards der Mikrobiomforschungsgemeinschaft, Naturmikrobiologie (2023). DOI: 10.1038/s41564-023-01361-7

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